Situat en la comarca de l'Alt Empordà, entre el Cap de Creus i el Montgrí, va ser declarat parc Natural l'any 1983. Es repartix entre els termes municipals de Peralada, Pedret i Marzà, Palau-saverdera, Pau, Castelló d´Empúries, Roses, Sant Pere Pescador, L´Armentera i L´Escala.
Té una superfície de 4.729 hectàrees. Després del parc Natural del delta de L´Ebre, constituïx la principal zona humida de Catalunya per la riquesa de les espècies animals i vegetals que conviuen: fins a tres-centes espècies diferents.